Al MGCN es duen a terme diverses línies de treball al voltant dels lepidòpters. Majoritàriament, la recerca es fonamenta en la base de dades fornida pel Catalan Butterfly Monitoring Scheme (CBMS), el projecte de seguiment de papallones diürnes a Catalunya. Tanmateix, altres línies de recerca exploren diversos aspectes de l’ecologia dels lepidòpters, i només es relacionen amb el CBMS de forma indirecta.